Управление реализацией Программы осуществляет министерство сельского хозяйства Астраханской области.
Оно осуществляет сбор отчетности о ходе выполнения программных мероприятий, подготавливает и в установленном порядке представляет в Минсельхоз России и министерство экономического развития Астраханской области отчеты о реализации Программы.