Взаимодействие государственных заказчиков подпрограмм осуществляет государственный заказчик-координатор - министерство образования и науки Астраханской области.
Государственные заказчики подпрограмм несут ответственность за выделенные финансовые средства на реализацию программных мероприятий и ежеквартально, до 10 числа месяца, следующего за отчетным периодом, представляют в министерство образования и науки Астраханской области информацию о ходе выполнения Программы. Министерство образования и науки Астраханской области направляет отчет о ходе реализации Программы в министерство экономического развития Астраханской области в установленном порядке. На основании бюджетных заявок, представленных государственными заказчиками подпрограмм, государственный заказчик-координатор Программы формирует сводную бюджетную заявку, предусматривая в ней объемы ассигнований на последовательную и поэтапную реализацию мероприятий Программы, и ежегодно представляет ее в министерство экономического развития Астраханской области. Министерство образования и науки Астраханской области совместно с государственными заказчиками подпрограмм осуществляет подготовку и представление в установленном порядке справочно-аналитической информации и ежегодных докладов о ходе реализации мероприятий Программы и эффективности использования финансовых средств.