Организацию управления реализацией Программы осуществляет государственный заказчик - министерство сельского хозяйства Астраханской области, которое осуществляет сбор отчетности о ходе выполнения программных мероприятий, подготавливает и в установленном порядке представляет в Министерство сельского хозяйства России и министерство экономического развития Астраханской области отчеты о реализации Программы.
Исполнители мероприятий Программы несут ответственность за ее качественное и своевременное выполнение, рациональное использование выделенных финансовых средств и представляют ежеквартально в министерство сельского хозяйства Астраханской области отчет о ходе ее исполнения.