Основными проблемами системы начального профессионального образования являются:
сохранение отраслевого характера структуры системы;
преобладание в профессионально-квалификационной структуре подготовки рабочих кадров и специалистов профессий для производственной сферы экономики (около 80 процентов от общего объема);
большинство учреждений начального профессионального образования находятся в федеральной собственности и более половины из них финансируется из федерального бюджета;
отсутствие средств на выпуск учебной литературы и учебных пособий;
сокращение инвестиций предприятий в развитие учебно-материальной базы учреждений начального профессионального образования;
отсутствие рабочих мест для прохождения производственной практики;
слабое участие работодателей в решении проблем начального профессионального образования.
Выход из создавшегося в системе начального профессионального образования положения возможен путем проведения комплексной реформы.