1-е направление - Инновационные проекты высшей школы.
В рамках данного направления определяются приоритетные направления инвестирования, выявляются наиболее перспективные разработки в области науки и научного обслуживания, а также вузы или другие организации высшей школы (научно-исследовательские институты, технопарки, опытные заводы, малые предприятия и т.д.), наиболее подготовленные к организации производства и выпуску высокотехнологической наукоемкой продукции. Создаются организационно-экономические условия для развития вузов, их подведомственных структур, других организаций высшей школы как самостоятельных товаропроизводителей на рынках научно-технической продукции и услуг, включая и услуги в области образования. Создается информационный банк данных по товарам и услугам, предоставляемым организациями высшей школы.
2-е направление - Новые экономические структуры высшей школы.
В рамках данного направления разрабатываются вопросы создания новых экономических структур (инвестиционных фондов, банков, страховых компаний, научно-производственных центров и т.д.), способствующих развитию рыночных механизмов в высшей школе, созданию новых рабочих мест для выпускников вузов в сфере науки, научно-технического предпринимательства, научного обслуживания; обеспечения поддержки интеграции создаваемых экономических структур с организациями и предприятиями других отраслей.
3-е направление - Подготовка и переподготовка кадров для научно-технического предпринимательства в высшей школе.
В рамках данного направления создается система ускоренной подготовки и переподготовки специалистов для работы в сфере научно-технического предпринимательства. Разрабатываются учебные программы, методические пособия, переоборудуются существующие и организуются на базе ведущих вузов новые центры подготовки в различных регионах Российской Федерации. Формируется система переподготовки кадров для специализированных фирм по сопровождению наукоемкого бизнеса (маркетингу, рекламе, патентованию и лицензированию, консалтинговым услугам). Решаются вопросы международного сотрудничества в области подготовки кадров для этой сферы деятельности, знакомства зарубежных предпринимателей с особенностями деятельности на российском рынке.
4-е направление - Информация и телекоммуникационные сети наукоемкого бизнеса в высшей школе.
В рамках данного направления создается информационное пространство, объединяющее в единую сеть крупные вузовские научные центры, головные вузы по выбранным направлениям и регионам, другие организации Госкомвуза России, активно участвующие в инновационной деятельности. Создается и оснащается сеть информационных центров для организации и поддержки распределенных баз данных, систем коллективного пользования удаленными базами данных, информационных банков по научно-техническим разработкам, наукоемким технологиям, товарам и услугам, предоставляемым организациями Госкомвуза России в области науки и научного обслуживания.
5-е направление - Малое предпринимательство в высшей школе и международное сотрудничество.
В рамках данного направления отрабатываются механизмы взаимодействия между организациями Госкомвуза России и зарубежными партнерами в лице университетов, компаний, фондов, различных государственных структур. Создается инфраструктура, способствующая быстрому выходу вузовских разработок на международный рынок научно-технической продукции и обеспечивающая организационно экономическую и правовую поддержку проектов и программ, предлагаемых вузами и другими экономическими структурами системы высшей школы. Осуществляется координация международного сотрудничества высшей школы с другими организациями, представляющими интересы Российской Федерации за рубежом.
6-е направление - Вопросы нормативно-правового обеспечения малого предпринимательства и новых экономических структур в науке и научном обслуживании высшей школы.
В рамках данного направления программы осуществляется подготовка проектов законодательных и нормативных документов, обеспечивающих эффективное функционирование новых экономических структур высшей школы в условиях рыночной экономики и многообразия форм собственности; разрабатываются механизмы взаимодействия органов государственного управления и подведомственных организаций Госкомвуза России при организации инвестиционной деятельности в области научно-технического предпринимательства.