2.1. Выявление, анализ и оценка противоправных действий по отношению к таможенным органам, сотрудникам и членам их семей со стороны преступных сообществ и отдельных лиц, ставящих целью нанести ущерб экономическим интересам Российской Федерации и склонить отдельных сотрудников к совершению противоправных деяний.
2.2. Предупреждение проникновения в кадровый состав таможенных органов Российской Федерации лиц, вынашивающих преступные намерения.
2.3. Разработка и осуществление совместно с другими подразделениями таможенных органов мер по защите должностных лиц и членов их семей от преступных посягательств на жизнь и здоровье в связи с их профессиональной деятельностью.
2.4. Разработка и проведение во взаимодействии с Региональным таможенным управлением по борьбе с таможенными правонарушениями специальных операций в целях физической защиты сотрудников таможенных органов, членов их семей и лиц, оказывающих конфиденциальное содействие.
2.5. Вскрытие фактов коррупции, должностных и уголовных правонарушений со стороны сотрудников таможенных органов Российской Федерации.
2.6. Участие совместно с руководителями и кадровыми аппаратами таможенных органов Российской Федерации в подборе и расстановке кадров, проведении воспитательно-профилактической работы с ними, укреплении служебной дисциплины.
2.7. Информационное обеспечение руководства ГТК России об отдельных элементах оперативной обстановки в интересах подготовки и реализации решений по совершенствованию деятельности таможенных органов, разработке и реализации таможенной политики.
2.8. Оказание методической и практической помощи таможенным органам Российской Федерации в организации и осуществлении их деятельности по обеспечению собственной безопасности. Контроль за осуществлением этой деятельности.
2.9. Оказание в пределах своей компетенции имеющимися силами и средствами содействия руководителям таможенных органов Российской Федерации в организации таможенных технологических процессов, внесение предложений по их доработке и качественному совершенствованию.
2.10. Участие во взаимодействии с подразделениями центрального аппарата ГТК России в пределах своей компетенции в разработке и осуществлении мер по контролю:
- за обеспечением сохранности сведений, составляющих государственную и служебную тайну;
- за соблюдением требований безопасности в области физической и технической защиты объектов таможенной инфраструктуры, сохранности оружия, боеприпасов и специальных средств;
- за соблюдением требований безопасности при эксплуатации в системе таможенных органов технических средств, обеспечивающих сохранность и передачу служебной информации, в том числе средств связи;
- за выездом за пределы Российской Федерации сотрудников таможенных органов;
- за подбором и изучением кадров.
2.11. Организация и осуществление взаимодействия по вопросам, относящимся к компетенции Управления, с правоохранительными и другими органами государственной власти и управления Российской Федерации.