ЦТЛ для выполнения возложенных на нее задач обладает следующими правами:
4.1. Получать от таможенных органов Российской Федерации в соответствии с законодательством Российской Федерации сведения и документы, необходимые для выполнения возложенных задач и осуществления ею своих функций, в том числе информацию о принятых решениях по результатам проведенных экспертиз.
4.2. Представлять интересы таможенных лабораторий в государственных органах и организациях.
4.3. Осуществлять по решению таможенных органов контрольные исследования соответствия показателей товаров заключениям специалистов, сертификатам и справкам, выдаваемым на них в таможенных целях экспертными и научно-исследовательскими организациями, не входящими в систему ГТК России.
4.4. Производить на договорной основе экспертизы по поручениям и постановлениям правоохранительных и судебных органов, а также исследования (экспертизы) товаров по обращениям государственных органов, организаций, предпринимателей и граждан. Доход от указанной деятельности используется на развитие ЦТЛ и увеличение расходов по заработной плате.
ЦТЛ вправе проводить экспертизы и исследования товаров на договорной основе при условии, что это не будет сказываться отрицательно на качестве и сроках выполнения ЦТЛ экспертиз и исследований товаров по поручениям и постановлениям таможенных органов.
4.5. Вносить в ГТК России предложения по организации деятельности ЦТЛ.
4.6. Издавать печатную продукцию по профилю своей деятельности.
4.7. Заключать в пределах своей компетенции с гражданами и организациями договоры, связанные с хозяйственной деятельностью.