Достижение основных целей и решение задач Программы основываются на следующих принципах:
1) ориентация на саморазвитие малых и средних городов, на мобилизацию их собственных возможностей и ресурсов (интеллектуальных, деловых, финансовых, производственных, сырьевых;
2) создание комплекса благоприятных условий и эффективных стимулов, способствующих мобилизации собственного потенциала городов в различных сферах социально-экономической деятельности;
3) привлечение к решению проблем городов ресурсов страны в целом, заинтересованных организаций, предприятий, различных фондов и других инвесторов;
4) ориентация на развитие местного самоуправления с созданием соответствующей финансовой базы и обеспечение органов местного самоуправления системой надежных правовых гарантий;
5) ориентация на поиск нестандартных решений проблем развития малых городов, создание условий для технологического прорыва в их экономике;
6) выявление и максимальное использование объективных преимуществ малых и средних городских поселений (экономических, социально-культурных, экологических и других) при одновременной целенаправленной реализации мер преодоления объективно присущих им недостатков;
7) создание условий и механизмов взаимодействия органов местного самоуправления с федеральными органами исполнительной власти и органами исполнительной власти субъектов Российской Федерации для решения общих задач развития малых и средних городов;
8) развитие непосредственного взаимодействия малых, средних городов и сельских населенных пунктов (финансово-экономические, социально-культурные, организационно-управленческие и другие прямые связи);
9) обеспечение баланса местных, региональных, федеральных интересов, позиций различных сторон (в том числе частных лиц) в процессе развития малых и средних городов с оценкой их приоритетности;
10) активное вовлечение населения в формирование и реализацию конкретных программ развития городов;
11) подключение к реализации Программы ее участников на добровольных началах;
12) открытость Программы по ее дальнейшему развитию, расширению круга участников, совершенствованию механизма реализации;
13) принципиальными положениями Программы являются ориентация на постоянное совершенствование мероприятий Программы и расширение круга охватываемых объектов, развертывание работ по опорным для реализации Программы городам;
14) дифференциация мер по развитию малых и средних городов с учетом типологии городов и их готовности к саморазвитию;
15) Программа синтезирует федеральные и региональные программы, действующие на территории городов, что способствует согласованности и комплексности выполнения работ на местах при соответствующем локальном согласовании планов и объединении ресурсов;
16) Программа является по существу программой социально-экономического реформирования малых и средних городов России, которая получит широкую общественную поддержку. Предпосылкой получения такой поддержки должно стать повышение уровня осведомленности широких кругов общественности о Программе и применение разнообразных механизмов привлечения общественных сил к ее реализации.