Сроки реализации Программы предусматриваются с 2014 по 2020 год.
Выполнение мероприятий, предусмотренных Концепцией, предлагается в 2 этапа:
первый этап - с 2014 по 2016 год;
второй этап - с 2017 по 2020 год.
Мероприятия первого этапа (2014-2016 годы) предусматривают проектирование, строительство и реконструкцию объектов мелиорации, создание нормативно-правового и научного обеспечения инновационного социально ориентированного развития мелиоративного комплекса, анализ существующего мелиоративного фонда в целях выбора объектов наиболее перспективных с точки зрения эколого-экономической и социальной эффективности, разработку проектно-сметной документации, в значительной мере направленной на создание условий, необходимых для эффективной реализации мероприятий Программы. В качестве первоочередных мероприятий первого этапа планируется проведение мероприятий по повышению безопасности гидротехнических сооружений, находящихся в федеральной собственности и собственности субъектов Российской Федерации, а также реконструкция мелиоративных систем, повышение водообеспеченности, выбор и проектирование новых мелиоративных объектов с преимущественным проведением гидротехнических мелиораций. Также будут проводиться работы по повышению плодородия почв путем проведения культуртехнических, агролесомелиоративных и других мероприятий.
В ходе второго этапа (2017-2020 годы) намечено продолжение работ по реконструкции и техническому перевооружению мелиоративных систем, строительству мелиоративных систем нового поколения, повышению безопасности гидротехнических сооружений и водообеспеченности земель сельскохозяйственного назначения, противопаводковым, противоэрозионным и другим мероприятиям, обеспечивающим предотвращение деградационных процессов и устойчивость агроландшафта, а также дальнейшее развитие научных исследований, разработка и внедрение инновационных технологий и новых высокоэффективных технических средств.