4. В состав Управления входят отделы:
отдел надзора за судоходством (отдел НС);
отдел организации расследования транспортных происшествий (отдел ОРТП);
отдел надзора за портовой деятельностью, судоходными и портовыми гидротехническими сооружениями (отдел НПСПГС);
отдел надзора за лицензированием и регистрацией судов и информационно-аналитического обеспечения (отдел НЛРСИАО).