Общее руководство чемпионатом таможенных органов Российской Федерации по служебному двоеборью среди сборных команд региональных таможенных управлений (РТУ) и таможен, непосредственно подчиненных ФТС России, осуществляет Управление государственной службы и кадров ФТС России.
Непосредственную организацию и проведение чемпионата осуществляет Центральное таможенное управление.
В течение 5 дней после окончания чемпионата судейская коллегия представляет в Управление государственной службы и кадров ФТС России следующие документы:
1) отчет главного судьи чемпионата;
2) отчет о медицинском обслуживании чемпионата;
3) акт приемки места проведения чемпионата.