Контроль за выполнением Программы осуществляют координатор Программы (Аппарат Правительства Российской Федерации) и государственный заказчик Программы, которые обеспечивают рассмотрение результатов мероприятий Программы на заседаниях Комиссии по организации подготовки управленческих кадров для организаций народного хозяйства Российской Федерации.
Государственный заказчик Программы обеспечивает размещение заказов на выполнение работ по реализации Программы в соответствии с Федеральным законом "О размещении заказов на поставки товаров, выполнение работ, оказание услуг для государственных и муниципальных нужд" и осуществляет контроль за ходом реализации Программы.