Разнообразие рыбохозяйственных водоемов различного типа определило в Российской Федерации развитие современного сельскохозяйственного рыбоводства по следующим направлениям:
прудовое рыбоводство с использованием полуинтенсивных и интенсивных методов разведения высокопродуктивных одомашненных видов и пород рыб;
индустриальное рыбоводство с разведением ценных видов и пород рыб, адаптированных к обитанию в условиях с высокими плотностями посадок и питанию комбикормами.
Выращиванием рыбы в Российской Федерации в последние 10 лет занимаются предприятия всех форм собственности. В основном в сельскохозяйственном рыбоводстве заняты предприятия малого бизнеса (субъекты малого и среднего предпринимательства). Основной объем товарной рыбы в Российской Федерации (более 70%) производят предприятия и организации, входящие в состав ассоциации "Государственно-кооперативное объединение рыбного хозяйства (Росрыбхоз)", фермерские хозяйства и индивидуальные предприниматели. В составе ГКО "Росрыбхоз" в настоящее время работает около 500 рыбоводных предприятий. Определенное развитие получило фермерское рыбоводство, однако учет рыбы в этом секторе рыбоводства в настоящее время затруднен и оценивается экспертным путем.