В формировании и реализации Программы принимают участие следующие федеральные органы исполнительной власти:
Министерство Российской Федерации по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий;
Министерство здравоохранения и социального развития Российской Федерации;
Федеральное медико-биологическое агентство;
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека;
Министерство природных ресурсов и экологии Российской Федерации;
Федеральная служба по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды;
Министерство сельского хозяйства Российской Федерации;
Федеральное агентство лесного хозяйства.
Кроме того, в формировании Программы принимают участие Российская академия наук, Российская академия сельскохозяйственных наук и Российская академия медицинских наук.