Основными проблемами развития агропромышленного комплекса являются:
проблема сбыта сельскохозяйственной продукции (низкие закупочные цены, недостаточность мощностей для длительного хранения зерна, неразвитость рыночных механизмов - зерновая биржа, электронные торги и т.д.);
слабый уровень селекции и производства новых сортов семян и пород скота;
низкий уровень экономических взаимоотношений между предприятиями химической отрасли, производителями минеральных удобрений и сельскохозяйственными товаропроизводителями;
недостаточный уровень развития рынка сельскохозяйственных угодий, включающий продажу, аренду и сделки, в том числе с земельными долями;
высокий уровень износа материально-технической базы сельскохозяйственного производства и перерабатывающей промышленности;
проблема мелиорации земель сельскохозяйственного назначения;
дефицит квалифицированных рабочих кадров и специалистов с необходимым уровнем подготовки;
неполная переработка вторичных продуктов и непищевых отходов, внедрение которой могло бы существенно снизить себестоимость продуктов питания и позволить значительно улучшить экологическую обстановку в регионе.