РАМДЦ в соответствии с возложенными на него задачами выполняет следующие основные функции:
а) разработка планов взаимодействия РАМДЦ с другими структурами ФМБА России в регионе с ежегодной их корректировкой;
б) обеспечение информационного обмена между Учреждениями и структурами аварийного реагирования других федеральных органов исполнительной власти в регионе;
в) создание и совершенствование информационно-аналитических, экспертных и расчетных программ, формирование специализированного программного обеспечения и баз данных, необходимых для оценки медико-санитарных последствий;
г) методическая поддержка Учреждений в регионе по вопросам создания, хранения, использования и восполнения резервов материальных ресурсов для ликвидации ЧС радиационного характера;
д) разработка номенклатуры оснащения и оборудования РАМДЦ и специализированных бригад;
е) организация и обеспечение круглосуточной работы службы оперативных дежурных в РАМДЦ;
ж) поддержание учебной базы для подготовки и переподготовки специалистов.