Общий порядок работы с программой выглядит следующим образом:
1. Субъектами Российской Федерации, территориальными органами и подведомственными организациями Федерального агентства водных ресурсов в базу данных программы вносятся все мероприятия, при этом по мере необходимости пополняется справочник организаций. Работы и ПИР вносятся только в разные объекты.
2. Затем субъектами Российской Федерации и подведомственными организациями Федерального агентства водных ресурсов производится отправка модулей на рассмотрение в соответствующие БВУ.
3. БВУ осуществляют загрузку данных в свой территориальный модуль.
4. Затем производится первичное рассмотрение и отбраковка объектов. На основании результатов рассмотрения производится заполнение полей "Решение БВУ" и "Приоритет" в базе данных программы.
5. На основании актуализированных данных формируются отчеты.
6. Модули уровня БВУ отправляются в Росводресурсы на заслушивание.