Начальник центра специальной и физической подготовки подчиняется начальнику физической подготовки округа (флота, объединения).
Он отвечает:
за организацию специальной физической подготовки в центре.
В дополнение к изложенному в статье 130 Устава внутренней службы Вооруженных Сил Российской Федерации начальник центра обязан:
руководить учебно-методической работой в центре;
разрабатывать и представлять на утверждение программы подготовки военнослужащих и инструкторов центра;
осуществлять контроль уровня профессиональной подготовки военнослужащих центра;
проводить работу по укомплектованию центра инструкторским составом;
осуществлять контроль учебного процесса с личным составом по всем разделам программы;
утверждать функциональные обязанности подчиненного личного состава;
откомандировывать военнослужащих из числа прибывших на занятия и нарушивших воинскую дисциплину, режим и распорядок дня, с последующим докладом начальнику физической подготовки по подчиненности.