3.1. Заповедник учрежден постановлением Совета Министров РСФСР от 05.12.86 N 96 и организован в соответствии с приказом Главохоты РСФСР от 19.12.86 N 498, распоряжениями исполнительного комитета Иркутского областного Совета народных депутатов от 29.07.85 N 373 и от 23.02.87 N 87, на территории общей площадью 659919 гектаров, включая смежные участки Качугского и Ольхонского районов Иркутской области.
3.2. На прилегающих к территории заповедника участках земли и водного пространства создается охранная зона в соответствии с Федеральным законом "Об особо охраняемых природных территориях".
3.3. К территории заповедника, в соответствии со статьей 10 Федерального закона "Об особо охраняемых природных территориях", в целях проведения научных исследований, экологического мониторинга, а также апробирования и внедрения методов рационального природопользования, не разрушающих природную среду и не истощающих биологические ресурсы, может быть присоединена территория биосферного полигона с дифференцированным режимом особой охраны и функционирования или же создана с теми же целями специальная охранная зона.