Контроль за реализацией Программы осуществляет утвердивший Программу руководитель Роскосмоса.
Ответственность за реализацию Программы противодействия коррупции в Роскосмосе и координацию мероприятий в рамках Программы осуществляет Комиссия, обеспечение проведения мероприятий осуществляет Управление кадров и безопасности.
Неотъемлемой составляющей механизма реализации Программы является использование на всех стадиях независимого мониторинга хода реализации Программы. Оперативная информация о ходе реализации мероприятий Программы, о нормативных актах по управлению Программой и об условиях проведения конкурсов размещается на официальном сайте Роскосмоса в международной компьютерной сети Интернет.