Срок реализации Программы - 2008-2011 годы.
Первый этап реализации Программы - 2008-2009 годы: разработка и принятие необходимого нормативного правового и методического обеспечения, должностных и административных регламентов, доработка имеющихся актов ФМБА России с учетом поручения Президента Российской Федерации от 31.07.2008 N Пр-1568, поручения Правительства Российской Федерации от 15.08.2008 N ВП-Ш6-5044, Национального плана противодействия коррупции.
Второй этап реализации Программы - 2009-2011 годы: реализация основных мероприятий программы.