3.1. Основными задачами Учреждения являются:
3.1.1. сохранение водных биологических ресурсов (далее - водных биоресурсов) в соответствии с законодательством Российской Федерации посредством осуществления на основе научных данных мер по изучению, воспроизводству, рациональному использованию водных биоресурсов и среды их обитания;
3.1.2. обеспечение государственного учета и государственного мониторинга состояния водных биологических ресурсов, включая функционирование отраслевой системы мониторинга водных биологических ресурсов и среды их обитания;
3.1.3. осуществление мероприятий по восстановлению водных биологических ресурсов и среды их обитания, нарушенных в результате стихийных бедствий и по иным причинам;
3.1.4. участие в реализации международных договоров и соглашений Российской Федерации в области рыболовства и рыбного хозяйства.
3.2. Основные виды деятельности (функции) Учреждения:
3.2.1. осуществление работ по воспроизводству и акклиматизации водных биоресурсов, рыбохозяйственной мелиорации водных объектов, спасению молоди водных биоресурсов в водных объектах, расположенных в зоне деятельности Учреждения;
3.2.2. сбор данных, анализ и подготовка материалов по заданию Комитета для обеспечения государственного учета добычи (вылова) водных биоресурсов, в том числе при осуществлении любительского и спортивного рыболовства, на основе отчетов и статистических данных, представляемых пользователями водных биологических ресурсов;
3.2.3. изучение совместно с научными рыбохозяйственными организациями водных биоресурсов водных объектов, расположенных в зоне деятельности Учреждения для выполнения задач и функций Учреждения в части обеспечения сохранения, воспроизводства, государственного мониторинга и рационального использования водных биоресурсов в соответствии с законодательством Российской Федерации;
3.2.4. подготовка по заданию Комитета материалов при проведении государственного мониторинга состояния водных биоресурсов и среды их обитания на водных объектах рыбохозяйственного значения в зоне деятельности Учреждения;
3.2.5. подготовка по поручению Комитета совместно с научными рыбохозяйственными организациями материалов для определения общих допустимых уловов на основе анализа данных государственного мониторинга водных биоресурсов и среды их обитания, разработка мер по обеспечению воспроизводства и рационального использования водных биоресурсов, а также оценка намечаемой хозяйственной деятельности, направленной на водные биоресурсы и среду их обитания, в том числе оценка непредотвратимого ущерба, размеров и направлений компенсационных мероприятий;
3.2.6. сбор данных и подготовка материалов по заданию Комитета для обеспечения формирования реестра пользователей водными биологическими ресурсами в зоне деятельности Учреждения;
3.2.7. подготовка предложений по определению категорий водных объектов рыбохозяйственного значения и особенностей их использования;
3.2.8. участие по поручению Комитета в приемке рыбоводной продукции, выпускаемой в естественные водоемы и водохранилища организациями;
3.2.9. участие в разработке правил рыболовства и подготовка предложений для внесения изменений и дополнений в правила рыболовства;
3.2.10. сбор данных и подготовка материалов по заданию Комитета для обеспечения ведения государственного кадастра водных биоресурсов водных объектов рыбохозяйственного значения, находящихся в зоне деятельности Учреждения с использованием необходимых информационных систем и баз данных;
3.2.11. участие в подготовке совместно с научными рыбохозяйственными организациями предложений по разработке нормативов допустимого воздействия на водные объекты (допустимого совокупного воздействия всех источников, расположенных в пределах речного бассейна или его части, на водный объект или его часть) и нормативов предельно-допустимых концентраций вредных веществ в водах водных объектов рыбохозяйственного значения в зоне деятельности Учреждения;
3.2.12. осуществление ихтиологических наблюдений за эффективностью рыбозащитных устройств и гибелью рыбы на водозаборных сооружениях, находящихся в зоне деятельности Учреждения;
3.2.13. определение совместно с рыбохозяйственными научно-исследовательскими организациями размера ущерба, нанесенного водным биоресурсам в водных объектах, расположенных в зоне деятельности Учреждения, и среде их обитания, в натуральном и (или) стоимостном выражении, направление материалов в уполномоченные органы государственной власти для предъявления исков по его возмещению в соответствии с гражданским законодательством;
3.2.14. осуществление рыбоводно-мелиоративных и других мероприятий по восстановлению водных биоресурсов и среды их обитания в водных объектах, расположенных в зоне деятельности Учреждения, нарушенных в результате стихийных бедствий и по иным причинам;
3.2.15. проведение работ по сохранению редких, находящихся под угрозой исчезновения и ценных видов водных биологических ресурсов в управляемых условиях, содержание их маточных стад и коллекций, участие в международных и межправительственных программах по обеспечению сохранения биоразнообразия в области водных биоресурсов;
3.2.16. подготовка предложений по совершенствованию информационного и организационно-методического обеспечения мероприятий по сохранению, изучению, воспроизводству и рациональному использованию водных биоресурсов и среды их обитания, организация выполнения для этих целей научно-исследовательских работ по поручению Комитета;
3.2.17. организационное и информационно-методическое обеспечение любительского и спортивного рыболовства осуществляемого в соответствии с действующим законодательством на отведенных Учреждению для этих целей рыбопромысловых участках, а также на водных объектах или их частях, расположенных в зоне действия Учреждения, на которых права организации любительского и спортивного рыболовства не ограничены действующим законодательством;
3.3. Виды приносящей доход деятельности Учреждения, осуществляемые по договорам на возмездной основе с юридическими и физическими лицами, по ценам, установленным в соответствии с законодательством Российской Федерации:
3.3.1. предоставление информационно-консультационных услуг юридическим и физическим лицам, в том числе: разработка рыбоводно-биологических обоснований на ведение рыбохозяйственной деятельности на водных объектах; составление рыбохозяйственных характеристик водных объектов и рыбопромысловых участков; подготовка материалов для выдачи заключений по оценке воздействия на водные биоресурсы и среду их обитания при размещении и эксплуатации хозяйственных объектов, а также по внедрению новых технологических процессов, влияющих на состояние водных биоресурсов и среду их обитания;
3.3.2. предоставление рыболовам-любителям при осуществлении ими любительского и спортивного рыболовства орудий лова, плавательных средств, бытового обслуживания, сервисных и транспортных услуг;
3.3.3. добыча (вылов) водных биоресурсов в научно-исследовательских и контрольных целях, в целях рыбоводства, воспроизводства и акклиматизации водных биоресурсов для выполнения задач и функций Учреждения;
3.3.4. осуществление после использования в целях, указанных в пп.3.3.3, реализации рыбной продукции первичной переработки, полученной из уловов водных биоресурсов, для выполнения задач и функций Учреждения и возмещения (компенсации) затрат на добычу (вылов) и реализацию;