2.1. Верификация результатов диагностики опасных инфекционных болезней бактериальной и вирусной природы, проведенных Центрами индикации и диагностики опасных инфекционных болезней Роспотребнадзора.
2.2. Идентификация возбудителей опасных инфекционных болезней неустановленной этиологии с тяжелым клиническим течением (включая летальный исход), представленных Центрами индикации и диагностики опасных инфекционных болезней Роспотребнадзора.
2.3. Проведение молекулярно-эпидемиологических исследований и изучение вирусологических, бактериологических, молекулярно-биологических, серологических, иммунохимических свойств особо опасных патогенов.
2.4. Хранение коллекционных штаммов, охраноспособное и авторское депонирование.
2.5. В пределах своей компетенции Центр осуществляет:
2.5.1. Проведение научно-исследовательских работ по изучению свойств особо опасных патогенов, разработку и изучение эффективности диагностических, профилактических и лечебных препаратов и схем лечения особо опасных инфекций;
2.5.2. Своевременное предоставление информации о результатах проведенных исследований в Федеральную службу по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека;
2.5.3. Поддержание постоянной готовности лабораторных и вспомогательных подразделений Центра к проведению исследований особо опасных патогенов;
2.5.4. Контроль за регулярной профессиональной подготовкой и повышением квалификации специалистов Центра для работы с особо опасными патогенами;
2.5.5. Проведение инспектирования диагностической деятельности специализированных лабораторий Центров индикации и диагностики опасных инфекционных болезней Роспотребнадзора;
2.5.6. Проведение молекулярно-эпидемиологического мониторинга за особо опасными инфекциями и разработку математических моделей с прогнозированием последствий вспышек особо опасных инфекционных заболеваний.