Исполнение государственной функции осуществляется Федеральной службой по надзору в сфере природопользования (далее - Росприроднадзор), осуществляющей функции Административного органа СИТЕС в Российской Федерации в отношении видов дикой фауны и флоры, находящихся под угрозой исчезновения, кроме осетровых видов рыб (далее - Административный орган СИТЕС в России). Приказом Росприроднадзора назначается руководитель Административного органа СИТЕС в России и его заместители, которым предоставляется право подписи разрешений СИТЕС.
Выдача разрешений СИТЕС, за исключением случаев:
- цирковых гастролей;
- охотничьих и рыболовных трофеев;
- музейных и выставочных экспонатов;
- единичных образцов животных и растений, являющихся собственностью физических лиц;
- животных, разведенных в неволе, и растений, выращенных в искусственных условиях;
- на вывоз образцов, ранее ввезенных в Российскую Федерацию;
- на вывоз и ввоз образцов, ввезенных в Российскую Федерацию до включения их в Конвенцию СИТЕС, а также видов животных и растений, включенных в Приложение III СИТЕС,
производится на основании положительной рекомендации Научного органа СИТЕС в России.
Функции Научного органа СИТЕС в России осуществляют Всероссийский научно-исследовательский институт природы (ВНИИприроды) и Институт проблем экологии и эволюции имени А.Н.Северцова РАН (ИПЭЭ РАН) (далее - научный орган СИТЕС в России).