В соответствии с пунктом 1 статьи 83 Кодекса в целях проведения налогового контроля налогоплательщики подлежат постановке на учет в налоговых органах соответственно по месту нахождения организации, месту нахождения ее обособленных подразделений, месту жительства физического лица, а также по месту нахождения принадлежащего им недвижимого имущества транспортных средств и по иным основаниям, предусмотренным Кодексом.
Вместе с тем у организаций могут возникать обязанности по уплате отдельных видов налогов и сборов, но при этом отсутствовать основания для постановки на учет в налоговом органе, установленные Кодексом.
При возникновении обязанности у организации по уплате отдельных видов налогов и сборов, предусмотренных законодательством о налогах и сборах, в случае отсутствия у нее на территории, подведомственной налоговому органу, оснований для постановки на учет налоговые органы по месту уплаты отдельных видов налогов и сборов осуществляют учет организации.
В данном случае учет организации в налоговом органе ведется на основании письма (заявления) об обязанности организации по уплате отдельных видов налогов и сборов, при отсутствии у организации на территории, подведомственной налоговому органу, оснований для постановки на учет, установленных Кодексом (в произвольной форме) (код документа - 2801, справочник СДУНО). При этом налоговый орган вправе запросить у организации копию свидетельства о постановке на учет в налоговом органе налогоплательщика-организации, выданного налоговым органом по месту ее нахождения.
При учете в налоговом органе организации по месту уплаты отдельных видов налогов и сборов используется идентификационный номер налогоплательщика, присвоенный организации в налоговом органе по месту ее нахождения, но при этом присваивается соответствующий данному случаю код причины постановки на учет. Согласно СППУНО, таким кодом является код "41" - "Учет в налоговом органе организации, уплачивающей отдельные виды налогов, в случае отсутствия у нее на территории этого налогового органа оснований для постановки на учет".
Налоговый орган по месту уплаты организацией отдельных видов налогов и сборов обязан направить в налоговый орган по месту нахождения организации, а также самой организации письмо в произвольной форме о факте ее учета с указанием присвоенного кода причины постановки на учет.
При утрате организацией обязанностей по уплате отдельных видов налогов и сборов налоговый орган вправе самостоятельно принять решение о прекращении учета этой организации. В этом случае применяется код причины снятия с учета "31" - "Прекращение учета в налоговом органе организации при утрате у нее обязанности по уплате отдельных видов налогов в случае, когда у организации на территории данного налогового органа отсутствовали основания для постановки на учет" СПСУНО.
При этом уведомление о снятии с учета в налоговом органе юридического лица, образованного в соответствии с законодательством Российской Федерации, организации не выдается.
Налоговый орган по месту уплаты организацией отдельных видов налогов и сборов обязан проинформировать налоговый орган по месту нахождения организации о факте прекращения ее учета в связи с утратой организацией обязанностей по уплате отдельных видов налогов и сборов.
В качестве примера приводятся отдельные случаи применения кода причины постановки на учет "41":
1. Учет сведений об организации в налоговых органах по месту уплаты сбора за пользование объектами животного мира (письмо ФНС России от 18.09.2007 N СК-6-09/721@ "Об учете плательщиков сборов за пользование объектами животного мира").
2. Учет сведений об организации по месту нахождения недвижимого имущества, в случае подачи организацией документов в органы Росрегистрации для государственной регистрации прав на указанное имущество.
В случае подачи организацией документов в органы Росрегистрации для государственной регистрации соответствующих прав на недвижимое имущество при возникновении у организации обязанности по уплате соответствующих налогов на указанное имущество в целях учета организации по месту нахождения указанного недвижимого имущества представляется возможным в качестве основания ее учета использовать письмо (заявление) организации о ее обязанности по уплате отдельных видов налогов и сборов, при отсутствии у организации на территории, подведомственной налоговому органу, оснований для постановки на учет, установленных Кодексом (в произвольной форме) (код документа - 2801, справочник СДУНО) с представлением документов, подтверждающих факт подачи документов на государственную регистрацию прав.
При поступлении сведений о государственной регистрации соответствующих прав на указанное выше недвижимое имущество от органов Росрегистрации постановка на учет по данному основанию осуществляется в установленном порядке.
3. Учет организации, уплачивающей регулярные платежи за пользование недрами, в соответствии с Федеральным законом от 21.02.92 N 2395-1 "О недрах".