4.1. Метод выделения ДНК с помощью СТАВ:
- навеску исследуемого гомогенизированного продукта массой 100 мг поместить в микроцентрифужную пробирку типа Эппендорф на 1,5 мл;
- добавить 300 мкл деионизированной воды, перемешать шпателем;
- добавить 500 мкл лизирующего СТАВ-буфера с меркаптоэтанолом, тщательно перемешать шпателем;
- инкубировать при 65°С 90 минут;
- центрифугировать 10 минут при 13000 об/мин;
- перести 500 мкл супернатанта в чистую пробирку типа Эппендорф вместимостью 1,5 мл;
- добавить 500 мкл хлороформа, перемешать на вортекс 30 секунд;
- центрифугировать 10 минут при 13000 об/мин;
- перенести 500 мкл верхней фракции в чистую пробирку, добавить 500 мкл хлороформа, перемешать;
- центрифугировать 5 минут при 13000 об/мин;
- перенести верхнюю фракцию в чистую пробирку типа Эппендорф вместимостью 1,5 мл, не захватывая слой хлороформа;
- добавить 2 объема СТАВ-осаждающего буфера, перемешать пипетированием;
- инкубировать 60 минут при комнатной температуре;
- центрифугировать 5 минут при 13000 об/мин;
- удалить супернатант;
- растворить осадок в 350 мкл NaCl (1,2 М);
- добавить 350 мкл хлороформа, перемешать на вортекс 30 секунд;
- центрифугировать 10 минут при 13000 об/мин;
- перенести верхнюю фракцию в чистую пробирку типа Эппендорф вместимостью 1,5 мл;
- добавить 0,6 объема изопропилового спирта, перемешать;
- центрифугировать 10 минут при 13000 об/мин;
- удалить супернатант;
- добавить 500 мкл 70%-ного раствора этилового спирта и перемешать на вортекс;
- центрифугировать 10 минут при 13000 об/мин;
- удалить супернатант;
- подсушить осадок не более 5 минут при 65°C для удаления капель спирта;
- растворить осадок в 100 мкл деионизированной воды, осторожно встряхивая, полученный раствор ДНК готов для проведения полимеразной цепной реакции (ПЦР);