3.1. В состав Комиссии включаются с правом решающего голоса по одному представителю от Минэкономразвития России, Роснауки, Росимущества, ФНС России, а также представитель Минфина России. Председателем Комиссии назначается в установленном порядке заместитель руководителя Агентства. Председатель Комиссии руководит деятельностью Комиссии, председательствует на заседаниях, организует ее работу, осуществляет общий контроль за реализацией принятых Комиссией решений. В отсутствие председателя Комиссии, обязанности председателя исполняет его заместитель. Председатель Комиссии на период своего отсутствия имеет право назначить представителя Роснауки осуществлять полномочия председателя Комиссии (с правом решающего голоса) на основании надлежащим образом оформленной доверенности. Секретарем Комиссии с правом совещательного голоса назначается представитель Управления федерального имущества научной сферы Роснауки.
3.2. Комиссия самостоятельно определяет порядок организации своей работы. О месте, дате и времени проведения заседания Комиссии ее члены уведомляются телефонограммой. Заседание Комиссии является правомочным при участии в нем не менее двух третей от общего числа ее членов.
3.3. Комиссия принимает решение по рассматриваемому вопросу путем открытого голосования. Решение Комиссии принимается простым большинством голосов от числа членов Комиссии, участвующих в заседании. В случае равенства голосов решающим является голос председательствующего на заседании Комиссии. Решения Комиссии оформляются протоколами, которые подписываются председательствующим и секретарем Комиссии. Член Комиссии, не согласный с принятым решением, имеет право в письменном виде изложить свое особое мнение.
3.4. Протокол заседания, а также принятые Комиссией решения в течение трех дней со дня заседания направляются членам Комиссии.
3.5. Организационно-техническое обеспечение деятельности Комиссии осуществляет Управление федерального имущества научной сферы Роснауки.