Перечень мероприятий Программы структурно состоит из 8 направлений и подпрограммы.
Конкретный перечень мероприятий Программы по каждому направлению формируется разработчиками Программы на основе рекомендаций экспертного совета по научному сопровождению федеральной целевой программы "Национальная технологическая база" на 2002-2006 годы, в состав которого включены ведущие ученые и специалисты страны по указанным технологическим направлениям Программы. При этом отбор мероприятий для включения в Программу осуществляется на базе использования следующих критериев:
влияние на достижение приоритетных целей государственной политики (безопасность страны, экономический рост, здоровье нации, экологически благополучная среда обитания и др.);
масштаб действия мероприятия (многоотраслевой, межотраслевой, отраслевой);
степень влияния на конкурентные позиции отечественных товаропроизводителей в наукоемких секторах рынка;
уровень замещения импортной продукции;
влияние на ресурсосбережение.
Каждое из направлений в составе мероприятий Программы реализуется как совокупность программных элементов (технологических проектов). Конкретный перечень проектов, выполняемых на условиях открытого конкурса, определяется органами управления Программой в соответствии с актуальной для такого направления проблематикой, а также исходя из цели и задач Программы, объема выделенных бюджетных ассигнований и привлекаемых средств внебюджетных источников.
Последовательность действий при выявлении приоритетных направлений и выборе тематики реализуемых технологических проектов включает в себя следующие этапы:
анализ стратегических национальных интересов на прогнозируемый период и определение целей, которые необходимо достигнуть для их реализации;
выявление новых функциональных качеств (потребительских свойств) продукции и (или) услуг, играющих ключевую роль в достижении поставленных целей;
анализ проблем, требующих решения, и выявление технологического дефицита (какие технологии необходимо разработать или усовершенствовать для создания продукции с необходимыми свойствами);
определение тематики необходимых работ (технологических проектов) и требований к разрабатываемым технологиям для устранения технологического дефицита.