Основные направления финансирования Программы предусматривают проведение научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ и реализацию инвестиционных проектов по разработке и промышленному внедрению критических технологий (технологии новых материалов, общемашиностроительные технологии, базовые технологии энергетики, технологии перспективных двигательных установок, химические технологии и катализ, технологии морской техники, функционирующей в экстремальных природных условиях, технологии обеспечения безопасности жизнедеятельности человека, диагностики и его защиты от опасных заболеваний), проведение системно-аналитических исследований, связанных с проблемами развития технологической базы.