Общее управление реализацией федеральной целевой программы "Модернизация транспортной системы России (2002-2010 годы)" и подпрограммы осуществляет государственный заказчик-координатор программы - Министерство транспорта Российской Федерации.
Государственным заказчиком подпрограммы и главным распорядителем выделяемых на ее реализацию бюджетных средств является Федеральное дорожное агентство. Государственный заказчик подпрограммы с учетом финансовых средств, выделяемых из различных источников, и на основании предварительных результатов ее выполнения уточняет промежуточные сроки реализации мероприятий подпрограммы и объемы их финансирования, а также соответствующие показатели в 3-летнем плане инвестиционных и текущих расходов. Он осуществляет также координацию разработки и реализации программ по федеральным округам и субъектам Российской Федерации.
Государственный заказчик осуществляет свои функции во взаимодействии с заинтересованными федеральными органами исполнительной власти, органами исполнительной власти субъектов Российской Федерации и органами местного самоуправления.
На уровне субъектов Российской Федерации обеспечение развития и эксплуатации автомобильных дорог регионального значения должно осуществляться на основе разработки и реализации ими программ совершенствования автомобильных дорог регионального значения.
При текущем управлении подпрограммой государственным заказчиком выполняются следующие основные задачи:
мониторинг выполнения целевых показателей подпрограммы;
экономический анализ эффективности программных проектов и мероприятий;
сбор оперативной отчетной информации, подготовка и представление в установленном порядке квартальных и годовых отчетов, публикация отчетов в открытых источниках в установленные сроки;
подготовка предложений по составлению плана инвестиционных и текущих расходов на очередной период;
корректировка плана реализации подпрограммы по источникам и объемам финансирования и по перечню предлагаемых к реализации задач подпрограммы по результатам принятия федерального бюджета и уточнения возможных объемов финансирования из других источников.
В части развития автомобильных дорог регионального значения предполагается, что текущее управление подпрограммой будет осуществляться органами исполнительной власти субъектов Российской Федерации. При этом в системе организации текущего и оперативного управления должна быть обеспечена координация развития сети автомобильных дорог федерального, регионального и местного значения. Рекомендуется организация предоставления сводной отчетности о выполнении работ и финансировании дорожного хозяйства в субъектах Российской Федерации Федеральному дорожному агентству для составления сводного отчета.
Выполнение мероприятий подпрограммы организациями и предприятиями осуществляется посредством заключения государственных контрактов на конкурсной основе в соответствии с Федеральным законом "О конкурсах на размещение заказов на поставки товаров, выполнение работ, оказание услуг для государственных нужд".
Оценка результатов и показателей выполнения основных мероприятий подпрограммы, их эффективности осуществляется в порядке, установленном законодательством Российской Федерации.