Финансирование мероприятий подпрограммы предусматривается осуществлять за счет внебюджетных средств с использованием банковских кредитов и лизинга, а также средств федерального и регионального бюджетов.
В соответствии со структурной реформой железнодорожной отрасли осуществляется формирование пригородных пассажирских компаний, предусматривается выделение Федеральной пассажирской компании и формирование дочерних предприятий в конкурентном секторе.
С целью повышения эффективности инвестиций расширяется применение принципов проектного финансирования.
Государственную поддержку реализации подпрограммы предусматривается осуществлять по следующим основным направлениям:
реконструкция и строительство особо важных объектов транспортной инфраструктуры и в первую очередь объектов, обеспечивающих безопасность функционирования транспортной системы;
обновление и модернизация пассажирского подвижного состава;
научные исследования и инновационные научно-технические проекты, связанные с реализацией подпрограммы и имеющие общегосударственное значение.
Федеральная поддержка реализации подпрограммы может быть осуществлена по следующим основным направлениям:
строительство новых железнодорожных линий;
обеспечение научного сопровождения реализации подпрограммы.
Управление ходом реализации подпрограммы осуществляет государственный заказчик - Федеральное агентство железнодорожного транспорта.
Основными целями и задачами управления реализацией подпрограммы являются:
обеспечение эффективного и целевого использования средств, включая средства государственной поддержки, в соответствии с утвержденными в подпрограмме приоритетами;
разработка инвестиционных предложений и активный поиск инвесторов;
осуществление контроля при реализации инвестиционных проектов и передача в эксплуатацию законченных объектов.
Реализация подпрограммы осуществляется с применением системы государственных контрактов на закупку и поставку транспортных средств, технологического оборудования и другой продукции для федеральных государственных нужд, заключаемых государственным заказчиком с соответствующими исполнителями программных мероприятий.
В указанных контрактах определяются права и обязанности государственного заказчика и поставщиков по обеспечению государственных нужд, регулируются их отношения при выполнении государственного контракта и предусматривается осуществление государственным заказчиком контроля за ходом работ по его выполнению.
Отбор организаций - исполнителей подпрограммы осуществляется государственным заказчиком на конкурсной основе в соответствии с критериями и процедурой конкурсного отбора исполнителей и установленным порядком заключения государственных контрактов.
Система информационного обеспечения реализации подпрограммы предполагает ведение баз данных о ходе выполнения программных мероприятий, в том числе по регионам.
Орган управления реализацией подпрограммы осуществляется федеральным государственным учреждением "Дирекция государственного заказчика по реализации федеральной целевой программы "Модернизация транспортной системы России".
Орган управления реализацией подпрограммы обеспечивает в рамках делегированных ему государственным заказчиком полномочий выполнение следующих основных функций:
информационно-аналитическое обеспечение процесса реализации подпрограммы;
мониторинг реализации подпрограммы, подготовка предложений по ускорению или приостановке реализации отдельных мероприятий;
анализ количественных и качественных параметров состояния и развития транспортной отрасли и подготовка соответствующих предложений;
анализ, организация и контроль процесса реализации инвестиционных проектов;
анализ, организация и контроль выполнения научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ;
подготовка предложений по привлечению организаций для реализации инвестиционных и других проектов, предусмотренных подпрограммой;
подготовка отчетов о реализации подпрограммы и годового доклада о ходе реализации подпрограммы и об эффективности использования финансовых средств.