Программа реализуется в течение 9 лет в 2 этапа: первый этап 2007-2010 годы и второй этап - 2011-2015 годы.
С целью обеспечения готовности к масштабному серийному строительству энергоблоков атомных электростанций с реакторной установкой типа ВВЭР, отвечающих требованиями мирового рынка, на первом этапе проводится модернизация действующих энергоблоков атомных электростанций с целью продления сроков эксплуатации и завершается строительство энергоблоков высокой степени готовности, осуществляется строительство новых атомных электростанций на базе оптимизированного энергоблока с реакторной установкой типа ВВЭР, создаются условия для перехода к инновационному развитию атомной энергетики, проводится оптимизация состава и организационно-правовой структуры организаций атомного энергопромышленного комплекса.
На втором этапе осуществляется строительство ежегодно по 2 типовых серийных энергоблока атомных электростанций общей установленной электрической мощностью не менее 2 ГВт, создаются инновационные промышленные технологии ядерного топливного цикла с реакторами на быстрых нейтронах и с высокотемпературными тепловыми реакторами, укрепляются позиции России на мировых рынках продукции (работ, услуг) организаций атомного энергопромышленного комплекса, обеспечивается их конкурентоспособность в условиях интеграции в мировую экономику.