Целевая программа направлена на решение проблем информатизации здравоохранения по укрупненным блокам, включающим:
- информатизацию управления здравоохранением;
- информатизацию учреждений здравоохранения;
- информатизацию диагностики и выбора тактики лечения;
- информатизацию процессов при чрезвычайных ситуациях;
- информатизацию процессов в акушерстве и гинекологии;
- информатизацию процессов охраны здоровья детей;
- информатизацию противотуберкулезной службы;
- информатизацию онкологической службы;
- информатизацию психиатрической службы;
- информатизацию стоматологической помощи;
- информатизацию травматологической службы;
- информатизацию специализированных медицинских регистров;
- развитие информационной медицинской телекоммуникационной сети "MEDNET";
- методическое обеспечение информатизации здравоохранения.