Источниками финансирования при реализации программы являются бюджетное финансирование через Минздравмедпром России, Комитет при Президенте России по политике информатизации, РАМН и целевое финансирование проектов Программы за счет органов управления здравоохранением (местных бюджетов), а также средств коммерческих структур.
Объемы финансирования:
Общее финансирование работ по программе - 42307 млн. руб.
в т.ч. по другим федеральным программам - 808 млн. руб.
Общая стоимость вычислительной техники - 17490 млн. руб.
Общая стоимость НИР - 24809 млн. руб.
Из общей стоимости финансирование осуществляется:
за счет местного бюджета - 20623 млн. руб.
за счет бюджета РАМН - 690 млн. руб.
за счет коммерческих структур - 1286 млн. руб.