Важнейшими целевыми показателями Программы являются:
разработка и внедрение приоритетных для российского здравоохранения мониторинговых систем и универсальных АРМ на основе единых информационных технологий;
развитие информационно-аналитической и программно-технической базы, обеспечивающих федеральный, региональный и другие органы управления здравоохранением информацией по всем видам деятельности лечебно-профилактических учреждений, необходимой для обоснования принятия решений.
Задачи унификации программного обеспечения в системе здравоохранения, интегрирования информационных систем различного уровня, определения приоритетов в разработке проектов информатизации являются важной организационно-технической проблемой, решению которой должна способствовать новая программа.
Главная цель - создание новых информационных технологий на всех уровнях управления здравоохранением, основанных на использовании компьютерных и телекоммуникационных средств, создание новых интеллектуальных медикотехнологических систем, направленных на повышение качества и эффективности лечебно-профилактической помощи.