Программу предлагается осуществлять в 2 этапа.
I этап - 2007-2010 годы.
II этап - 2011-2015 годы.
На I этапе реализации Программы необходимо:
завершить выполнение основного комплекса мероприятий, связанных с созданием и развитием транспортной, энергетической и социальной инфраструктуры Курильских островов;
сформировать сеть предприятий по воспроизводству водных биологических ресурсов;
разработать нормативные правовые акты, регулирующие вопросы реструктуризации рыбохозяйственного комплекса Курильских островов, совершенствования механизма добычи водных биологических ресурсов путем создания особых экономических условий для ускоренного развития прибрежного рыболовства и рыбоводства, осуществления мер экономического стимулирования их интенсивного развития в соответствии с Концепцией развития рыбного хозяйства Российской Федерации на период до 2020 года.
В ходе реализации II этапа Программы предполагается смещение акцента с государственных инвестиционных ресурсов на внебюджетные источники финансирования мероприятий Программы, нацеленных на:
интенсивное развитие предприятий рыбохозяйственного комплекса, обеспечивающих воспроизводство водных биологических ресурсов, экономически эффективную их добычу и переработку;
диверсификацию экономики Курильских островов путем создания биофармацевтических предприятий на основе вовлечения в экономический оборот не используемых в настоящее время видов водных биологических ресурсов, развития и использования туристическо-рекреационного потенциала на базе уникальных природно-климатических особенностей Курильских островов, а также промышленной разработки их минерально-сырьевой базы.
Кроме того, при реализации Программы необходимо одновременное осуществление мероприятий, связанных с охраной водных биологических ресурсов в районе Курильских островов, и выделение дополнительных средств на материально-техническое обеспечение правоохранительных органов по борьбе с экономическими и налоговыми преступлениями в сфере добычи водных биологических ресурсов. Это позволит решить одну из острейших проблем региона - браконьерство. Такие мероприятия целесообразно осуществлять за счет увеличения объемов бюджетного финансирования заинтересованных федеральных органов исполнительной власти.