В Особой экономической зоне применяется особый порядок уплаты участниками налога на прибыль организаций, а также налога на имущество организаций.
Иные федеральные, региональные и местные налоги, сборы и взносы во внебюджетные фонды уплачиваются в соответствии с законодательством Российской Федерации о налогах и сборах, законодательством Калининградской области и нормативными правовыми актами органов местного самоуправления.