Управление российской военной базой на территории Республики Армения осуществляется соответствующим органом управления Вооруженных Сил Российской Федерации.
Орган управления российской военной базы в своей деятельности по вопросам организации оперативной и боевой подготовки воинских формирований базы, их материально-технического обеспечения, оказания лицам, входящим в состав российской военной базы, и членам семей этих лиц культурных, медицинских, торговых, бытовых и коммунальных услуг взаимодействует с Министерством обороны Республики Армения, другими ведомствами.