Для непосредственного управления КТО в соответствии с решением высших органов управления государства создается оперативный штаб, возглавляемый специально назначенным должностным лицом (руководителем оперативного штаба).
Органы исполнительной власти государства, организации и граждане, привлекаемые для проведения КТО. с момента ее начала подчиняются руководителю оперативного штаба по управлению КТО, и его решения являются для них обязательными.
Вмешательство любого другого лица независимо от занимаемой должности в оперативное руководство КТО не допускается.