Приоритетными в программах сохранения редких и находящихся под угрозой исчезновения видов животных, растений и грибов являются способы их сохранения в природной среде обитания, поскольку только в такой среде возможно полноценное и долговременное сохранение живых организмов и продолжение их естественной эволюции.
Мероприятия по сохранению редких и находящихся под угрозой исчезновения видов животных, растений и грибов вне природной среды обитания являются частью программ по восстановлению видов и возвращению их в природу. Сохранение редких видов в искусственно созданной среде обитания необходимо применять в следующих случаях:
- если в настоящее время невозможно прекратить или снизить действие основных лимитирующих факторов;
- при критически низкой общей численности, обуславливающей недопустимо высокую вероятность случайного исчезновения вида (популяции) из природы;
- при сильных нарушениях генетической структуры популяций (включая снижение генетического разнообразия), приводящих к инбредной депрессии, снижению жизнеспособности особей и проявлению нетипичных для вида признаков;
- при разрушении механизмов самовосстановления популяции и необходимости ее искусственного воспроизводства.
Параллельно с сохранением вида вне природной среды обитания решаются задачи восстановления мест его обитания и прекращения/снижения воздействия основных лимитирующих факторов.
Исключением из этого правила является представляющее собой самостоятельную задачу сохранение в искусственно созданной среде обитания видов, которые исчезли из природы, и реинтродукция которых в ближайшем будущем не представляется возможной. Эти виды сохраняются в научных и образовательных целях, а также как носители генетической информации, потенциально полезной для человека в будущем.