2.1. Секретариат является постоянно действующим административным органом ШОС и осуществляет организационно-техническое и информационное обеспечение мероприятий, проводимых в рамках Организации, готовит предложения по ежегодному бюджету Организации, а также обеспечивает учет и хранение документов, принимаемых в рамках ШОС.
2.1.1. Секретариат изучает и обобщает поступившие от государств-членов предложения и материалы к повестке дня заседаний и/или совещаний органов ШОС, на их основе готовит предложения Совету национальных координаторов о предварительной повестке дня, сроках и месте проведения заседаний и/или совещаний органов ШОС.
2.1.2. По согласованию с Советом национальных координаторов рассылает государствам-членам предварительную повестку дня предстоящих заседаний и/или совещаний органов ШОС и поступившие от государств-членов предложения о включении в нее дополнительных пунктов; проекты документов, вносимых на рассмотрение органами ШОС; необходимые справочные и другие материалы, как правило, не позднее, чем за 20 дней до начала заседаний и/или совещаний органов ШОС, если не был установлен иной срок.
2.1.3. Организует консультации с представителями государств-членов по проектам документов, представляемых для рассмотрения на заседаниях и/или совещаниях органов ШОС.
2.1.4. Осуществляет организационно-техническое обеспечение заседаний и/или совещаний органов ШОС в соответствии с установленным регламентом и во взаимодействии с правительством государства, на территории которого проводится встреча.
2.1.5. Обеспечивает направление государствам-членам заверенных копий документов, принятых органами ШОС.
2.1.6. Участвует в подготовке проектов документов по обеспечению выполнения решений органов ШОС.
2.1.7. Готовит и выпускает информационный бюллетень Организации, а также создает и поддерживает веб-сайт ШОС.
2.1.8. Разрабатывает проекты планов работы органов ШОС и представляет их на утверждение Совета национальных координаторов.
2.1.9. Запрашивает у государств-членов информационно-справочные и другие материалы, необходимые для обеспечения работы органов ШОС. Создает банк данных по вопросам, являющимся предметом ведения Организации, и обеспечивает этой информацией государства-члены по их запросам.
2.1.10. Осуществляет протокольное обеспечение деятельности органов ШОС и Исполнительного секретаря.
2.1.11. Готовит предложения по финансированию деятельности Организации и Секретариата, представляет доклады о бюджете и исполнении бюджета, осуществляет текущий контроль за поступлением взносов, исполнением бюджета ШОС, а также расходованием средств, предназначенных на содержание Секретариата.
2.1.12. Поддерживает рабочие связи с другими международными организациями и государствами по вопросам, касающимся деятельности Организации.
2.1.13. Осуществляет набор сотрудников в целях обеспечения функционирования Секретариата.
2.1.14. По согласованию с государствами-членами организует научные симпозиумы и конференции.
2.2. Функции Секретариата могут быть изменены решением Совета глав государств по представлению Совета министров иностранных дел.