Основными задачами СПЭБ являются:
- участие в организации и проведении комплекса экстренных противоэпидемических мероприятий по выявлению, локализации и ликвидации очагов карантинных и других опасных инфекционных болезней, в том числе в случаях их завоза из-за рубежа;
- участие в организации и проведении комплекса профилактических и противоэпидемических мероприятий в зонах чрезвычайных ситуаций, направленных на предупреждение и снижение инфекционной заболеваемости населения, а также оценку и прогнозирование санитарно-эпидемиологической ситуации;
- участие в организации и проведении комплекса экстренных противоэпидемических мероприятий по локализации и ликвидации очагов, возникших вследствие активизации природных очагов инфекционных болезней;
- диагностика заболеваний неясной этиологии и индикация возбудителей инфекционных болезней в объектах окружающей среды.
- оказание консультативно-методической и практической помощи учреждениям санитарно-эпидемиологической службы, лечебно-профилактическим учреждениям в организации и проведении противоэпидемических и профилактических мероприятий в зоне чрезвычайной ситуации.