На первом этапе (2003 год) осуществляется разработка концептуальных документов, нормативных правовых актов, инструкций, методик и регламентов, определяющих механизмы формирования и функционирования, в том числе:
концепция и положение о Единой информационно-аналитической системе природопользования и охраны окружающей среды;
программа работ по созданию и развитию Единой информационно-аналитической системы природопользования и охраны окружающей среды;
проект решения Правительства Российской Федерации по вопросу создания и развития Единой информационно-аналитической системы природопользования и охраны окружающей среды;
создание Российского фонда информации по природным ресурсам и охране окружающей среды, фондов информации государственных служб МПР России и территориальных фондов информации;
регламенты функционирования Ситуационного центра МПР России;
регламенты обмена природоресурсной информацией на межведомственном, межрегиональном и территориальном уровнях;
разработка нормативной правовой базы функционирования Единой информационно-аналитической системы природопользования и охраны окружающей среды.
На втором этапе (2004-2010 годы) достигается устойчивое функционирование и дальнейшее развитие Единой информационно-аналитической системы природопользования и охраны окружающей среды, предусматривающее:
создание единого информационного пространства в сфере природопользования и охраны окружающей среды на основе реализации проекта Единой информационно-аналитической системы природопользования и охраны окружающей среды;
многоуровневое и межведомственное информационное взаимодействие в сфере природопользования и охраны окружающей среды.