Защита нарушенных или оспоренных прав заказчиков объектов экспертизы в области государственной экспертизы осуществляется через суд, арбитражный суд или третейский суд в соответствии с подведомственностью дел, установленной процессуальным законодательством.
Защита прав заказчиков объектов экспертизы в области государственной экспертизы в административном порядке осуществляется лишь в случаях, предусмотренных государственным законом. Решения, принятые в административном порядке, могут быть обжалованы в суде.