1. Отдел материально-технического обеспечения
2. Отделение сводного планирования материально-технического обеспечения
3. Отделение обеспечения техническими средствами таможенного контроля и вооружением (пункт в редакции приказа ГТК России от 24 февраля 2004 года N 221 - см. предыдущую редакцию)
4. Отделение обеспечения транспортной техникой
5. Отделение вещевого обеспечения
6. Отделение обеспечения печатной продукцией
7. Отдел капитального строительства, эксплуатации и развития объектов таможенной инфраструктуры
8. Отделение капитального строительства объектов таможенной инфраструктуры
9. Отделение эксплуатации объектов таможенной инфраструктуры
10. Отделение охраны труда и пожарной безопасности
11. Отдел социального развития
12. Отдел медицинского обеспечения
13. Здравпункт (на правах отделения)
14. Отделение продовольственного обеспечения
15. Автотранспортный отдел
16. Отделение организации проведения конкурсных торгов
17. Отделение документационного обеспечения.