1. Отдел кадров
2. Отделение кадров управления
3. Отдел инспектирования и профилактики правонарушений
4. Отдел специальной проверки и архивных фондов
5. Отдел подготовки кадров
6. Отдел подготовки кадров (на правах учебного центра)
7. Отделение физической подготовки
8. Организационно-штатное отделение
9. Отдел организации и контроля прохождения службы
10. Отдел организации работы с кадрами таможенных органов
11. Психологическое отделение
12. Отделение документационного обеспечения.