Подпрограмма реализуется государственным заказчиком совместно с заинтересованными федеральными органами исполнительной власти с использованием всех рычагов экономической политики кредитно-денежного механизма, государственной контрактной системы, налогового и антимонопольного законодательства.
Исполнителями мероприятий подпрограммы будут предприятия судостроительной промышленности, научные центры, проектные организации, а также предприятия смежных отраслей промышленности и нефтегазового комплекса. Реализация подпрограммы осуществляется с применением системы государственных контрактов (договоров), заключаемых в установленном порядке государственным заказчиком подпрограммы с головными исполнителями мероприятий.
Отбор исполнителей мероприятий осуществляется путем проведения конкурсов среди предприятий, организаций и учреждений независимо от формы собственности, в том числе иностранных, в соответствии с Федеральным законом "О конкурсах на размещение заказов на поставки товаров, выполнение работ, оказание услуг для государственных нужд".
Основной целью организации конкурсов является стимулирование инвестиционной активности и привлечение средств отечественных и иностранных частных инвесторов.
Привлечение этих средств предусматривается осуществлять в соответствии с Бюджетным кодексом Российской Федерации на возвратной и платной основе.
Возврат бюджетных средств будет осуществляться посредством реализации научно-технической продукции, опытных и серийных образцов создаваемой техники за счет:
прямых поступлений налогов от продажи научно-технической продукции или лицензий на ее использование небюджетным организациям, в том числе иностранным;
увеличения объемов производства технических средств добычи углеводородов вследствие использования научно-технической продукции и, соответственно, увеличения налоговых отчислений;
увеличения объемов продаж нефти и газа вследствие возрастания их добычи благодаря созданию дополнительных технических средств добычи углеводородов.
Расчеты и технико-экономические обоснования показывают, что срок окупаемости вложенных бюджетных средств составит 6-8 лет с начала реализации подпрограммы.