После утверждения Программы Правительством Российской Федерации и открытия финансирования из федерального бюджета для реализации ее мероприятий разработчики-исполнители организуют предконтрактную (преддоговорную) проработку размещения заказов для федеральных государственных нужд на конкурсной основе и последующее размещение заказов с заключением договоров на выполнение конкретных мероприятий Программы. Государственные заказчики через разработчиков-исполнителей контролируют ход выполнения договорных обязательств непосредственными исполнителями.
С учетом реализации системы программных мероприятий государственные заказчики Программы уточняют объемы необходимых средств для их финансирования в очередном году и представляют проект соответствующей бюджетной заявки с ее обоснованием в Министерство экономического развития и торговли Российской Федерации, Министерство финансов Российской Федерации и Министерство образования и науки Российской Федерации для включения в перечень федеральных целевых программ, принимаемых к финансированию из федерального бюджета на очередной финансовый год (абзац в редакции постановления Правительства Российской Федерации от 22 декабря 2004 года N 826 - см. предыдущую редакцию).
При необходимости Федеральная служба Российской Федерации по контролю за оборотом наркотиков вносит предложения в Министерство экономического развития и торговли Российской Федерации, Министерство образования и науки Российской Федерации и Министерство финансов Российской Федерации о продлении срока реализации Программы (абзац в редакции, введенной в действие с 1 июля 2003 года постановлением Правительства Российской Федерации от 15 июля 2003 года N 427; в редакции постановления Правительства Российской Федерации от 17 ноября 2004 года N 648; в редакции постановления Правительства Российской Федерации от 22 декабря 2004 года N 826 - см. предыдущую редакцию).