В результате реализации подпрограммы будет предотвращена деградация территорий и восстановлены природные экосистемы Волжского бассейна, создана система регламентации хозяйственной деятельности, что положительно скажется на снижении уровня загрязнения природной и в первую очередь водной среды.
Создание общебассейновой системы мониторинга окружающей природной среды позволит оперативно принимать меры, обеспечивающие экологическую безопасность в бассейне реки Волги.
Экономическая эффективность подпрограммы предположительно составит 35,8 млрд. рублей. Ожидаемая социальная эффективность выражается в улучшении условий проживания 61 млн. жителей Волжского бассейна.