Подпрограмма предусматривает в 2010 году довести объем вылова рыбы и нерыбных объектов до 5,5 млн. тонн (в том числе во внутренних водоемах - до 0,65 млн. тонн), что выше уровня 2000 года на 38 процентов; произвести 3,7 млн. тонн пищевой рыбной продукции, включая консервы, что на 27 процентов выше уровня 2000 года; произвести 800 млн. условных банок рыбных консервов, увеличив данный показатель в 2,1 раза по сравнению с 2000 годом. При увеличении добычи водных биоресурсов в 2010 году на 38 процентов по сравнению с 2000 годом балансовая прибыль от основной деятельности увеличится на 84 процента.
Развитие рыбохозяйственного комплекса в перспективе позволит существенно расширить базу налогообложения, особенно в части пополнения местных бюджетов в наиболее отдаленных районах страны на севере Европейской части России и Дальнем Востоке. В среднем ежегодно будут поступать в виде разного рода платежей, включая плату за водные биоресурсы, денежные средства в размере не менее 12 млрд. рублей. За период действия подпрограммы в федеральный бюджет можно ожидать поступления от налогов и платежей за пользование водными биологическими ресурсами на сумму более 100 млрд. рублей.
Развитие предприятий рыбного хозяйства в перспективе позволит сохранить рабочие места в рыбохозяйственных регионах, в том числе на Севере, создать не менее 40 тыс. рабочих мест на берегу в прибрежных районах, особенно на Дальнем Востоке (Камчатке, Сахалине и в Приморском крае).
Реализация намеченных в подпрограмме мероприятий, особенно в части развития флота, прибрежного рыболовства и аквакультуры, будет способствовать развитию смежных отраслей (судостроения, судоремонта, машиностроения, тарного производства) и других отраслей экономики - сельского хозяйства, пищевой индустрии, торговли и др.
Реализация подпрограммы позволит в 2010 году по сравнению с 2000 годом обеспечить дополнительную поставку на российский рынок отечественных рыбных товаров в объеме не менее 0,8 млн. тонн. В результате среднедушевое потребление их в стране за этот период возрастет более чем в 1,5 раза и составит не менее 18 килограммов.